Las divisiones inferiores son una parte transcendental en el funcionamiento del club, quien dispone de buena parte de su presupuesto en estas mismas. Las divisiones inferiores han sido grandes protagonistas en el aporte de jugadores al primer equipo a lo largo de la historia, contando con temporadas en las cuales canteranos llegaron al equipo profesional con más frecuencia que en otras, pero la mayor parte del tiempo la cantera «bizantina» responde cuando el club necesita el ascenso de algún juvenil, al ser una academia heredera de Byzantion, se destaca que en esta academia se formaron jugadores como [[Aitor Iturrieta Navarro]], [[Danilo Alba]] y [[Rafael Vilallonga]]
Las divisiones inferiores son una parte transcendental en el funcionamiento del club, quien dispone de buena parte de su presupuesto en estas mismas. Las divisiones inferiores han sido grandes protagonistas en el aporte de jugadores al primer equipo a lo largo de la historia, contando con temporadas en las cuales canteranos llegaron al equipo profesional con más frecuencia que en otras, pero la mayor parte del tiempo la cantera «bizantina» responde cuando el club necesita el ascenso de algún juvenil, al ser una academia heredera de Byzantion, se destaca que en esta academia se formaron jugadores como [[Aitor Iturrieta Navarro]], [[Danilo Alba]] y [[Rafael Vilallonga]]
|}La academia juega en el '''Estadio Blaquerna''', con capacidad de 600 personas, aunque pueden llegar hasta 6.000 dependiendo de los padres y familiares que lleguen a ver a sus hijos jugar.
El estadio fue diseñado por José Casanova y Mauricio Devia, construyéndose en 4 meses. fue construido para albergar los partidos del FCB Academia y también los partidos amistosos del primer equipo. Debe su nombre en memoria del antiguo barrio del mismo nombre, donde se encuentra el Patriarcado Ecuménico de Constantinopla.
La construcción de Blanquerna es similar al estadio [[Rey de Reyes]], con muchas similitudes en apariencia. El estadio tiene una capacidad de 600 asientos con 2 gradas separadas en el lado este y sur, mientras que se espera que se amplíe construyendo otra tribuna en el lado oeste alcanzando una capacidad de entre 4000 y 600 asientos.
El estadio se encuentra al lado de la [[Casa Galata]], centro residencial de los jovenes de la academia.
Fútbol Club Bizancio Academia(3109507) es el equipo juvenil y sub 18 de FC Bizancio, fundado oficialmente en el año 2024, es el equipo heredero de Byzantion JC y conformado por la fusión de dicha institución con la academia juvenil de Bizancio National creada 5 meses antes. El presidente de ese entonces, Rómulo Keller, nombró a una comisión para la reconstrucción de la academia que tuviera los mismos estándares de formación de la antigua Byzantion, por lo que encargaron a Daniel Peiralillo la coordinación y conformación del campo técnico de la academia.
Para mediados del año 2024, ya estaba en pleno funcionamiento, entrando a una liga internacional la cual, al tener su administración vacante, el equipo decidió tomar el cargo de administrador de la liga.
Las divisiones inferiores son una parte transcendental en el funcionamiento del club, quien dispone de buena parte de su presupuesto en estas mismas. Las divisiones inferiores han sido grandes protagonistas en el aporte de jugadores al primer equipo a lo largo de la historia, contando con temporadas en las cuales canteranos llegaron al equipo profesional con más frecuencia que en otras, pero la mayor parte del tiempo la cantera «bizantina» responde cuando el club necesita el ascenso de algún juvenil, al ser una academia heredera de Byzantion, se destaca que en esta academia se formaron jugadores como Aitor Iturrieta Navarro, Danilo Alba y Rafael Vilallonga
Bizancio Plc
Eloy Buzeta
Turquinho Bueno
Pablo de la Ossa
Jorge Esplandatkoulos
Gustaaf de Moll 
Gianni Battiston
